Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL1Q9NR64 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL1Q9NR64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms