Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE4Q9NR33 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE4Q9NR33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms