Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM7Q9NQW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM7Q9NQW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms