Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A3Q9NQ40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A3Q9NQ40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC52A3Q9NQ40 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms