Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD93Q9NPY3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD93Q9NPY3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD93Q9NPY3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms