Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKKSQ9NPJ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKKSQ9NPJ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms