Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD7Q9NPI1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD7Q9NPI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD7Q9NPI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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