Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB9BQ9NP90 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB9BQ9NP90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB9BQ9NP90 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 669.6 ms