Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VTA1Q9NP79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VTA1Q9NP79 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VTA1Q9NP79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms