Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF304Q9HCX3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF304Q9HCX3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF304Q9HCX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms