Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4CQ9HCJ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4CQ9HCJ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms