Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX17Q9H6I2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX17Q9H6I2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX17Q9H6I2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX17Q9H6I2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX17Q9H6I2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX17Q9H6I2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX17Q9H6I2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms