Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRABDQ9H4I3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABDQ9H4I3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms