Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIOBPQ9H2D6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOBPQ9H2D6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIOBPQ9H2D6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIOBPQ9H2D6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIOBPQ9H2D6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIOBPQ9H2D6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIOBPQ9H2D6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIOBPQ9H2D6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms