Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF3Q9H094 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF3Q9H094 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms