Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LSG1Q9H089 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSG1Q9H089 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms