Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PAIP1Q9H074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAIP1Q9H074 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAIP1Q9H074 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAIP1Q9H074 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms