Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM39BQ9GZU3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39BQ9GZU3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms