Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM4Q9C037 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM4Q9C037 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM4Q9C037 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM4Q9C037 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms