Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RNF17Q9BXT8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RNF17Q9BXT8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RNF17Q9BXT8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RNF17Q9BXT8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms