Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA4Q9BXL8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDCA4Q9BXL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CDCA4Q9BXL8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDCA4Q9BXL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms