Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM2D1Q9BX74 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TM2D1Q9BX74 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms