Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX73

TM2D2, TM2 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2Q9BX73 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D2Q9BX73 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D2Q9BX73 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms