Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAMP8Q9BV40 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP8Q9BV40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms