Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPON2Q9BUD6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPON2Q9BUD6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPON2Q9BUD6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms