Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS4Q9BT78 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms