Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CRACR2AQ9BSW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRACR2AQ9BSW2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRACR2AQ9BSW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms