Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP3Q9BQQ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP3Q9BQQ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms