Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM7Q9BQ49 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms