Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP2Q99959 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP2Q99959 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms