Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGREF1Q99674 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CGREF1Q99674 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CGREF1Q99674 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms