Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A3Q99624 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A3Q99624 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A3Q99624 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms