Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC9Q96Q05 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC9Q96Q05 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC9Q96Q05 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms