Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF3Q96PU9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms