Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCEEQ96PE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MCEEQ96PE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms