Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRC7Q96NW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC7Q96NW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRC7Q96NW7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms