Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
JSRP1Q96MG2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms