Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFRQ96KR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFRQ96KR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms