Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APIPQ96GX9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APIPQ96GX9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APIPQ96GX9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms