Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MVB12AQ96EY5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MVB12AQ96EY5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms