Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNFT2Q96EX2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNFT2Q96EX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNFT2Q96EX2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms