Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MFSD3Q96ES6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MFSD3Q96ES6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms