Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHFRQ96EP1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHFRQ96EP1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHFRQ96EP1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms