Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3CQ96E17 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3CQ96E17 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms