Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP4Q96DX8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP4Q96DX8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP4Q96DX8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms