Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTHRC1Q96CG8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTHRC1Q96CG8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms