Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIFAQ96CG3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TIFAQ96CG3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIFAQ96CG3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms