Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HGDQ93099 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HGDQ93099 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HGDQ93099 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HGDQ93099 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HGDQ93099 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HGDQ93099 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HGDQ93099 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HGDQ93099 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HGDQ93099 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HGDQ93099 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HGDQ93099 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HGDQ93099 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HGDQ93099 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HGDQ93099 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HGDQ93099 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HGDQ93099 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HGDQ93099 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HGDQ93099 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HGDQ93099 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HGDQ93099 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HGDQ93099 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HGDQ93099 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HGDQ93099 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HGDQ93099 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HGDQ93099 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HGDQ93099 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HGDQ93099 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HGDQ93099 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HGDQ93099 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HGDQ93099 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HGDQ93099 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HGDQ93099 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HGDQ93099 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HGDQ93099 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HGDQ93099 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HGDQ93099 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HGDQ93099 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HGDQ93099 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HGDQ93099 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HGDQ93099 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HGDQ93099 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HGDQ93099 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HGDQ93099 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HGDQ93099 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HGDQ93099 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HGDQ93099 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HGDQ93099 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HGDQ93099 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HGDQ93099 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HGDQ93099 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HGDQ93099 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HGDQ93099 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HGDQ93099 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HGDQ93099 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HGDQ93099 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HGDQ93099 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms