Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRF1Q92994 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRF1Q92994 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRF1Q92994 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms