Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PMM1Q92871 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMM1Q92871 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PMM1Q92871 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms